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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
20/12/2010 |
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Data da última atualização: |
19/01/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LOCALI-FABRIS, E. C.; MAFRA, V. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO- ALVES, M.; FRANCISCO, C. S.; FREITAS ASTUA, J. de; KISHI, L. T.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Valéria S. Mafra, APTA; Polyana Kelly. Martins, APTA; Marcelo Ribeiro-Alves, Fiocruz; Carolina S. Francisco, APTA; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF; Luciano T. Kishi, APTA; Marcelo A. Machado, APTA. |
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Título: |
Gene set enrichment analysis in sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
0058 PSO
Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010 |
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Conteúdo: |
Huanglongbing (HLB) is known as the most devastating disease of citrus. Two species of Candidatus Liberibacter have been reported in Brazil, Ca. L. asiaticus (CaLas) and Ca. L. americanus (CaLam). Since CaLas is prevalent worldwide, most of the studies have focused that species and very little information is available on CaLam. With the objective to investigate differences in metabolic pathways of Citrus sinensis in response to CaLam, we used a genome- wide microarray approach to identify differentially expressed genes in symptomatic plants when compared to control plants. Hybridizations were performed by Roche Nimblegen with a customized 385K chip containing 32,000 unigenes of C. sinensis. The raw data were pre-processed using the Robust Multiarray Average (RMA). Normalized data were imported to R/Bioconductor where statistical analyses were performed. A Bayesian moderated t-test was calculated and p-values were adjusted for multiple comparisons by the false discovery rate correction. A total of 634 genes with P-values ?0.05, fold change |FC| ? 2.0 and odds probability ? 0.95 were considered differentially expressed. From those, 419 were up- and 215 down-regulated in symptomatic plants. In order to identify enriched gene ontologies regulated in infected plants we applied a gene set enrichment analysis approach and found 45 different biological processes including those involved in response to jasmonic acid stimulus, signaling and metabolism, 17 molecular functions, including oxygen binding, monooxygenase activity and oxidoreductase activity, 6 cellular components, mostly related to chloroplast, enriched at a statistically significant level of 0.001. MenosHuanglongbing (HLB) is known as the most devastating disease of citrus. Two species of Candidatus Liberibacter have been reported in Brazil, Ca. L. asiaticus (CaLas) and Ca. L. americanus (CaLam). Since CaLas is prevalent worldwide, most of the studies have focused that species and very little information is available on CaLam. With the objective to investigate differences in metabolic pathways of Citrus sinensis in response to CaLam, we used a genome- wide microarray approach to identify differentially expressed genes in symptomatic plants when compared to control plants. Hybridizations were performed by Roche Nimblegen with a customized 385K chip containing 32,000 unigenes of C. sinensis. The raw data were pre-processed using the Robust Multiarray Average (RMA). Normalized data were imported to R/Bioconductor where statistical analyses were performed. A Bayesian moderated t-test was calculated and p-values were adjusted for multiple comparisons by the false discovery rate correction. A total of 634 genes with P-values ?0.05, fold change |FC| ? 2.0 and odds probability ? 0.95 were considered differentially expressed. From those, 419 were up- and 215 down-regulated in symptomatic plants. In order to identify enriched gene ontologies regulated in infected plants we applied a gene set enrichment analysis approach and found 45 different biological processes including those involved in response to jasmonic acid stimulus, signaling and metabolism, 17 molecular functions, includin... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Huanglongbing; Plant disease. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Fruta Cítrica. |
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Thesaurus Nal: |
Candidatus Liberibacter; Citrus. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aHuanglongbing (HLB) is known as the most devastating disease of citrus. Two species of Candidatus Liberibacter have been reported in Brazil, Ca. L. asiaticus (CaLas) and Ca. L. americanus (CaLam). Since CaLas is prevalent worldwide, most of the studies have focused that species and very little information is available on CaLam. With the objective to investigate differences in metabolic pathways of Citrus sinensis in response to CaLam, we used a genome- wide microarray approach to identify differentially expressed genes in symptomatic plants when compared to control plants. Hybridizations were performed by Roche Nimblegen with a customized 385K chip containing 32,000 unigenes of C. sinensis. The raw data were pre-processed using the Robust Multiarray Average (RMA). Normalized data were imported to R/Bioconductor where statistical analyses were performed. A Bayesian moderated t-test was calculated and p-values were adjusted for multiple comparisons by the false discovery rate correction. A total of 634 genes with P-values ?0.05, fold change |FC| ? 2.0 and odds probability ? 0.95 were considered differentially expressed. From those, 419 were up- and 215 down-regulated in symptomatic plants. In order to identify enriched gene ontologies regulated in infected plants we applied a gene set enrichment analysis approach and found 45 different biological processes including those involved in response to jasmonic acid stimulus, signaling and metabolism, 17 molecular functions, including oxygen binding, monooxygenase activity and oxidoreductase activity, 6 cellular components, mostly related to chloroplast, enriched at a statistically significant level of 0.001.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
03/02/2015 |
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Data da última atualização: |
19/08/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MIRANDA, T. R.; SOUZA, A. M.; MENEZES, K. O. de; PAZ, H. H. R.; FERNANDES, M. H. de A.; OLIVEIRA, J. E. de M. |
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Afiliação: |
TANIRA R. MIRANDA; ADRIANA M. SOUZA; KAREN O. DE MENEZES; HUANNA HUBIA R. PAZ; MARIA HERLÂNDIA DE A. FERNANDES; JOSE EUDES DE MORAIS OLIVEIRA, CPATSA. |
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Título: |
Eficiência do subproduto da extração do óleo de algodão no controle de fêmeas adultas de Tetranychus urticae. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 25., 2014, Goiânia. Entomologia integrada à sociedade para o desenvolvimento sustentável: anais. Goiânia: Sociedade Entomológica do Brasil, 2014. |
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Descrição Física: |
1 Pen drive. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Tetranychus urticae (Koch), é considerada a principal praga da videira na região do Submédio do Vale do São Francisco. Nos últimos anos, os viticultores tem enfrentados grandes problemas e desafios no controle dessa praga. Atualmente, a principal forma de controle dessa praga é com uso de acaricidas sintéticos. Devido ao uso frequente, alguns problemas associados foram surgindo ao longo do tempo, sendo um deles o surgimento de populações resistentes. Com a necessidade de testar métodos eficientes, seguros e economicamente viáveis, foi avaliado a eficiência de controle do subproduto gerado da extração do óleo de algodão sobre fêmeas adultas de T. urticae com histórico de resistência a abamectina. O experimento foi testado as dosagens de 2; 4; 6; 7 e 8g/500mL de água. Fêmeas adultas de T. urticae foram transferidas para placas de Petri de 9 cm de diâmetro (dez fêmeas/placa) contendo discos de folha (3 cm de diâmetro) de Canavalia ensimorfis, acondicionados sobre papel filtro e sobrepostos em espuma de polietileno. As aplicações ocorreram por meio de pulverização em torre de Potter com um volume de calda de 2mL/placa. O teste controle utilizou-se apenas água destilada. As avaliações do número de ácaros vivos e mortos foram realizadas 48h após aplicação. As dosagens de 7 e 8g/500mL apresentaram mortalidade de 85 e 91%, respectivamente. Com base nesses resultados, o subproduto gerado da extração do óleo de algodão mostrou-se eficiente no controle de fêmeas adultas de T. urticae. |
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Palavras-Chave: |
Insect; Óleo de algodão. |
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Thesagro: |
Ácaro rajado; Controle biológico; Inseto; Praga; Tetranychus Urticae; Uva. |
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Thesaurus NAL: |
Grapes. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117163/1/Eudes-16-cpatsa.pdf
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Marc: |
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520 $aTetranychus urticae (Koch), é considerada a principal praga da videira na região do Submédio do Vale do São Francisco. Nos últimos anos, os viticultores tem enfrentados grandes problemas e desafios no controle dessa praga. Atualmente, a principal forma de controle dessa praga é com uso de acaricidas sintéticos. Devido ao uso frequente, alguns problemas associados foram surgindo ao longo do tempo, sendo um deles o surgimento de populações resistentes. Com a necessidade de testar métodos eficientes, seguros e economicamente viáveis, foi avaliado a eficiência de controle do subproduto gerado da extração do óleo de algodão sobre fêmeas adultas de T. urticae com histórico de resistência a abamectina. O experimento foi testado as dosagens de 2; 4; 6; 7 e 8g/500mL de água. Fêmeas adultas de T. urticae foram transferidas para placas de Petri de 9 cm de diâmetro (dez fêmeas/placa) contendo discos de folha (3 cm de diâmetro) de Canavalia ensimorfis, acondicionados sobre papel filtro e sobrepostos em espuma de polietileno. As aplicações ocorreram por meio de pulverização em torre de Potter com um volume de calda de 2mL/placa. O teste controle utilizou-se apenas água destilada. As avaliações do número de ácaros vivos e mortos foram realizadas 48h após aplicação. As dosagens de 7 e 8g/500mL apresentaram mortalidade de 85 e 91%, respectivamente. Com base nesses resultados, o subproduto gerado da extração do óleo de algodão mostrou-se eficiente no controle de fêmeas adultas de T. urticae.
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650 $aPraga
650 $aTetranychus Urticae
650 $aUva
653 $aInsect
653 $aÓleo de algodão
700 1 $aSOUZA, A. M.
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700 1 $aPAZ, H. H. R.
700 1 $aFERNANDES, M. H. de A.
700 1 $aOLIVEIRA, J. E. de M.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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